《表1 试验中所用的引物》
采用PCR-DGGE法。按照土壤提取试剂盒提取总DNA,并对提取的DNA进行琼脂糖凝胶电泳分析。细菌16 S rDNA V3片段的扩增采用通用引物对R518/F341,引物序列见表1。扩增条件为94℃,预变性2 min;98℃变性10 s,58℃退火15 s,68℃延伸1 min,25个循环。细菌基因组PCR扩增产物经QIAquick Gel Extraction Kit(Qiagen货号:28704)进行纯化,并对PCR扩增产物进行电泳分离。将PCR产物加入到10%的聚丙烯酰胺凝胶中,采用40%~60%凝胶变性梯度。电泳条件:缓冲液1×TAE,温度60℃,电压100 V,时间20 h。电泳结束后,采用硝酸银快速银染。用凝胶成像分析系统分析染色后的凝胶,观察电泳条带并拍照。选择条带切胶回收、连接pEasy-T载体,将其转化大肠杆菌DH5α感受态细胞后,送TaKaRa公司进行测序。将有效序列在NCBI的Blast程序进行比对,找出与目的片段相似度高的菌种[14-15]。
图表编号 | XD0054622700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.15 |
作者 | 王国夫、孙小红、方逸、周瑾、沈倩婷、项俊蕾、金仙玲、罗杏韵 |
绘制单位 | 绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院、绍兴文理学院元培学院 |
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