《表1 试验中用到的引物及其序列》

《表1 试验中用到的引物及其序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《茶树钙依赖性蛋白激酶基因CsCDPK17的鉴定及表达分析》


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使用龙井43的cDNA为模板,以在转录组中通过同源比对得到的候选序列为参考,设计引物使用RT-PCR进行基因全长克隆验证。基因克隆选用KOD-Plus-Neo(Toyobo,日本)高保真Taq酶,PCR反应体系为50μL,包括以下组分:以10倍稀释的上述cDNA 1.0μL为模板、10×KOD buffer 5.0μL、上下游引物各1.5μL、dNTP 5.0μL、KOD-Plus-Neo 1.0μL、MgSO4 4.0μL,其余用ddH2O补足。PCR反应程序为:首先经94℃预变性3 min;然后98℃变性10 s,56℃退火30 s,68℃延伸90 s,38个循环;68℃延伸7 min,于4℃保存。反应结束后的RCR产物进行1%琼脂糖凝胶电泳检测,对目标条带切胶回收,连接到Blunt-zero(TransGen,中国)克隆载体,转化DH5α大肠杆菌,涂板后37℃培养12~14 h,挑取单克隆进行测序验证。基于已经发表的舒茶早基因组序列信息[18],通过比对获得目标基因转录起始位点(ATG)前约2 000 bp的启动子区序列,设计引物,以龙井43的DNA为模板进行RT-PCR扩增,PCR产物经1.0%琼脂糖凝胶电泳检测,切胶回收、连接入克隆载体、涂板挑取单克隆测定启动子区序列。引物合成和测序由上海华津生物有限公司完成,本研究中涉及的引物及序列见表1。