《表2 干酪乳杆菌spacer对应的原间隔区序列特点》

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《干酪乳杆菌CRISPR基因座分析》


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为了确定CRISPR间隔区的可能起源,研究其与已知序列的同源性。得到与干酪乳杆菌的部分间隔区高度匹配的噬菌体或质粒序列,其中包括某些完全匹配(表2)。BD-Ⅱ、BL23、LC2W、W56的spacer21序列均与乳杆菌的质粒pREN 100%匹配。ZHANG的spacer14序列与乳酸乳球菌乳酸亚种和乳酸乳球菌乳脂亚种的质粒仅有一个碱基错配。Spacer15序列与巴克乳杆菌、副干酪乳杆菌、卡氏双球菌、植物乳杆菌、短乳酸杆菌、乳明串珠球菌、戊糖片球菌中的质粒有1—3个碱基错配。