《表2 核盘菌假定几丁质酶家族蛋白性质分析》

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《核盘菌几丁质酶基因家族分析与表达特性研究》

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核盘菌中共12个假定的几丁质酶蛋白，分别为SS1G_11212，SS1G_00677，SS1G_03420，SS1G_05897，SS1G_11304，SS1G_11700，SS1G_00773，SS1G_05454，SS1G_08020，SS1G_12510，SS1G_13155和SS1G_08695.几丁质酶蛋白相对分子质量在3.4×104~1.9×105之间.等电点（PI）值位于4.49~8.29之间.除SS1G_11212为疏水性蛋白外（GRAVY值为0.117），其余蛋白均为亲水性蛋白（GRAVY值为负数）.利用SignalP 4.1进行信号肽预测分析发现，其中6个假定的几丁质酶（SS1G_00773，SS1G_00677，SS1G_03420，SS1G_05454，SS1G_11700，SS1G_08695）在N端具有典型的信号肽结构，信号肽的平均长度为19.3.利用ProtComp 9.0对假定的几丁质酶进行蛋白定位预测，结果表明具有信号肽的假定几丁质酶均位于胞外.在另外6个假定的几丁质酶中，SS1G_05897，SS1G_08020，SS1G_11304和SS1G_11212位于胞外，SS1G_13155定位于细胞核，SS1G_12510位于细胞质中（表2）.对假定的几丁质酶进行蛋白结构分析，结果表明12个蛋白均含有糖苷水解酶18（Glyco_18）催化结构域.此外，SS1G_00677，SS1G_00773，SS1G_05454和SS1G_12510蛋白还具有几丁质结合结构域（Chitin-binding domain，ChtBD）.SS1G_11212和SS1G_08695蛋白中具有纤维素结合结构域（Cellulose-binding domain，CBM）（图1） .