《Table 2 The primers for RT-qPCR assays》
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《CBP/P300介导的PTIP乙酰化可能促进下游肿瘤相关基因CCDC121和GPR75的转录》
在HeLa细胞中分别转染si CTR和si PTIP,将野生型He La细胞和PTIP敲低的He La细胞各分成3份,送去RNA测序(上海美吉生物医药科技有限公司)。对P<0.05的表达差异基因进行筛选,计算实验组PTIP敲低和对照组PTIP野生型中Fpkm平均值上调或者下调的倍数并排序,Fpkm数值表示该基因转录本的表达水平,选择下调倍数靠前的基因进行进一步验证。通过SYBR Green实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RT-qPCR)检测差异基因中下调显著的基因mRNA表达水平,肌动蛋白作为检测内参。采用相对定量法表示基因的相对mRNA水平,公式是2^-ΔΔCt,ΔCt=Ct(目的基因)-Ct(内参基因)。RT-qPCR检测引物序列如Table 2。
图表编号 | XD0041582600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.20 |
作者 | 钟燕燕、王嘉东 |
绘制单位 | 北京大学基础医学院放射医学系系统生物医学研究所、北京大学基础医学院放射医学系系统生物医学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |