《表1 引物和探针:基于双重微滴数字PCR精准定量转基因水稻G6H1的方法研究》

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《基于双重微滴数字PCR精准定量转基因水稻G6H1的方法研究》


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SPS:蔗糖合成酶;PLD:磷脂酶D家族;PEPC:磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶;G6H1:转基因水稻品系;下同SPS:Sucrose phosphate synthase;PLD:Phospholipase D family;PEPC:Phosphoenolpyruvate carboxylase;G6H1:Transgenic rice line;The same below

根据转基因水稻G6H1左边界旁侧翼序列信息,通过Primer express 3.0软件设计转基因水稻G6H1转化体特异性引物和探针。3个常用水稻内源基因分别为:蔗糖合成酶(sucrose phosphate synthase,SPS),磷脂酶D家族基因(phospholipase D family,PLD),磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶基因(phosphoenolpyruvate carboxylase gene,PEPC)。SPS、PLD和PEPC的检测引物和探针均引用自相应标准方法。G6H1转化体特异性探针5'端修饰基团为绿色荧光蛋白(green fluorescent protein,GFP),各内源基因探针5'端修饰基团为6-羧基荧光素(6-carboxy-fluorescein,FAM),引物与探针的具体信息见表1。引物和探针均由生工生物工程(上海)有限公司合成。