《表1 耐四环素基因引物序列》
利用SYBR GreenⅡ定量PCR,选取两种典型的四环素耐药基因(tetA、tetO)进行定量检测。这两种基因代表了细菌对四环素具有耐受性的两种重要机制,tetA可以编码四环素外排泵蛋白,而tetO可以编码核糖体保护蛋白[12]。四环素耐药基因引物的建立和优化参照文献[1]进行。引物序列及相关信息见表1。将耐药基因导入质粒当中进行无性增殖从而获得含目的基因的质粒,对其进行转化、提取后通过紫外分光光度计检测其浓度。进行4~5个梯度稀释,以初始浓度的对数为横坐标、CT值为纵坐标绘制标准曲线(R2均大于0.99)。用SYBR GreenⅡPremix(天根)试剂进行实时定量PCR反应(ABI7500)。PCR反应体系(体积为20μL),包括染料试剂10μL,目的基因上、下游引物各0.3μL,待测DNA模板1μL,无菌水8.4μL。反应程序:先在94℃下预变性3 min,再在94℃下变性10 s,然后根据表1退火温度退火30 s,最后在72℃下充分延伸32s,共进行40个循环。每个样品平行测定3次以确保准确性,每组基因PCR回收效率在88%~110%之间。
图表编号 | XD0032083200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.03.01 |
作者 | 汪喜生、吕瑞滨、沈怡雯、郭美婷 |
绘制单位 | 上海城投污水处理有限公司石洞口污水处理厂、上海城投污水处理有限公司石洞口污水处理厂、上海城投污水处理有限公司石洞口污水处理厂、同济大学环境科学与工程学院 |
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