《表3 抗氧化肽研究中的常用数据库及工具》

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《抗氧化肽的研究现状》


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生物信息学工具(In silico tools)为预测、分析和筛选抗氧化肽提供了一种经济、有效的手段,成为近年来抗氧化肽研究的一种新兴方法。利用生物信息学工具可分析和挖掘数据库中的各种蛋白质序列信息,寻找生物活性肽的潜在前体;预测所选蛋白质序列的潜在生物活性图谱,计算所选蛋白质序列中潜在生物活性片段的出现频率;分析酶切位点,筛选合适的蛋白酶,优化母体蛋白的可控水解;进行目标肽的生物活性预测,二级结构预测,感官特性(甜、苦、鲜味等)、毒性和过敏性预测以及理化性质(分子质量、等电点、疏水性、溶解性等)评价和构效关系分析等[45-46]。基于局部比对算法的搜索工具(BLAST)、BIOPEP数据库工具以及分子对接工具(Molecular docking)等一些流行的生物信息学工具(表3)已广泛应用于抗氧化肽的相关研究中。在这些工具的辅助下,已从动物、植物以及肉类等产品中成功地获得了多种不同的抗氧化活性肽[35,47-49]。