《表2 q RT-PCR引物信息》

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《口腔白斑病组织中环状RNA的差异表达谱分析》


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根据高通量测序结果,选取表达差异程度较显著的circ RNA(FC越大,P值越小越佳;原始信号表达值越平均越佳),并结合功能分析结果,共选取10个circ RNA,采用测序的6对样本进行q RT-PCR验证。对提取的RNA使用Super ScriptⅢ逆转录试剂盒逆转录为c DNA文库。选取GAPDH为内参,使用Vii A 7实时荧光定量PCR仪,采用q PCR SYBR Green master mix试剂盒进行q RT-PCR。本研究所用引物序列由上海生工提供,引物序列见表2。采用2-ΔΔCt法对目的基因的相对表达水平进行计算分析,得到各目的基因差异表达情况。根据PCR选取circ RNA进行酶耐受实验,使用RNase处理提取的RNA,37℃水浴20 min,结果合格者进行sanger测序验证。另选OLK与NOM的样本组织各20例,对筛选合格circ RNA circ HLA-C进行q RT-PCR进行验证。