《表2 q RT-PCR引物信息》
根据高通量测序结果,选取表达差异程度较显著的circ RNA(FC越大,P值越小越佳;原始信号表达值越平均越佳),并结合功能分析结果,共选取10个circ RNA,采用测序的6对样本进行q RT-PCR验证。对提取的RNA使用Super ScriptⅢ逆转录试剂盒逆转录为c DNA文库。选取GAPDH为内参,使用Vii A 7实时荧光定量PCR仪,采用q PCR SYBR Green master mix试剂盒进行q RT-PCR。本研究所用引物序列由上海生工提供,引物序列见表2。采用2-ΔΔCt法对目的基因的相对表达水平进行计算分析,得到各目的基因差异表达情况。根据PCR选取circ RNA进行酶耐受实验,使用RNase处理提取的RNA,37℃水浴20 min,结果合格者进行sanger测序验证。另选OLK与NOM的样本组织各20例,对筛选合格circ RNA circ HLA-C进行q RT-PCR进行验证。
图表编号 | XD00194973000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.05.20 |
作者 | 徐思明、宋雨翰、邵彦雄、陶岚、周海文 |
绘制单位 | 上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔黏膜病科国家口腔疾病临床研究中心上海市口腔医学重点实验室上海市口腔医学研究所、上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔黏膜病科国家口腔疾病临床研究中心上海市口腔医学重点实验室上海市口腔医学研究所、上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔黏膜病科国家口腔疾病临床研究中心上海市口腔医学重点实验室上海市口腔医学研究所、上海交通大学医学院附属第九人民医院·口腔医学院口腔综合科国家口腔疾病临床研究中心上海市口腔医学重点实验室上海市口腔医学研究所、 |
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