《表1 差异基因荧光定量引物序列》

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《大豆四粒荚突变体子房转录组分析》

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注：#ID表示差异基因的ID值；Annotation代表差异基因在GO数据库中的功能注释信息

依据转录组测序结果，挑选出10个在野生型和突变体间都具有GO功能注释的差异表达基因（log2 ratio=-19.49～19.43）为验证基因，其中6个为上调表达基因，4个为下调表达基因，利用Beacon Disigner 8设计荧光定量PCR引物，具体序列见表1。这10个差异表达基因提取RNA时所用材料与构建转录组差异文库完全相同。荧光定量PCR的总反应体系为25μL，包括2μL cDNA（25 ng/μL），12.5μL 2×SYBR premix Ex taq?（Takara，Dalian，China），10μM上下游引物，1.5μL dNTP（10 mM），5μL ddH2O，轻轻混匀后放置于Agilent Technologies Stratagene Mx3000 P PCR仪中进行循环反应。