《表2 长白猪CIDEB蛋白的氨基酸组成》

《表2 长白猪CIDEB蛋白的氨基酸组成》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《长白猪CIDEB基因真核表达载体构建及生物信息学分析》


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由ORF finder预测得知,猪CIDEB基因编码219个氨基酸。经在线预测软件ProtParm分析CIDEB蛋白的理化性质,可知其蛋白的分子质量为24.653 ku,带负电荷的氨基酸残基数(Asp+Glu)为23,带正电荷的氨基酸残基数(Arg+Lys)为28,故整个蛋白质带正电荷。CIDEB分子式为C1097H1759N309O318S9,原子总数为3 492。理论等电点(PI)为9.13。CIDEB水溶液在280 nm处的消光系数为31 065,对光的吸收程度较大。CIDEB不稳定系数是47,即长白猪CIDEB属于稳定蛋白,脂肪族氨基酸指数为92.60,并且CIDEB蛋白半衰期在动物细胞可达30 h。肽链N端为甲硫氨酸(Met),肽链C端为酪氨酸(Tyr),遵循N-端规则。由长白猪CIDEB蛋白的氨基酸残基组成可知(表2),氨基酸残基中频率最高的是亮氨酸(Leu,占15.53%),频率最低的是半胱氨酸(Cys,占1.37%),不含有吡咯赖氨酸(Pyl)及硒半胱氨酸(Sec)。通过Protscale在线软件对长白猪CIDEB蛋白做疏水性分析(图2),该氨基酸序列纵坐标多于0值以上,为亲水性残基,平均疏水指数为-0.323,因此蛋白整体表现为亲水性。