《表3 井冈霉胺改造后的对接结合自由能》

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《小分子糖及其类似物与α-葡萄糖苷酶的分子对接》

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表3显示，化合物2、4中，不管在R1位还是R2位，只要引入N原子，对接结合自由能与井冈霉胺的结果基本一致；化合物1、3中，R1和R2位均无N原子，对接结合自由能较大，显示与酶的结合能力减弱；化合物5中，R1和R2位同时引入N原子，对接结合自由能明显变小，结合程度变得更牢固。上述结果提示，在类似的小分子结构中，N原子在与α-葡萄糖苷酶对接中起着非常重要的作用。含N原子的六元杂环结构的小分子带—NH2取代基后，能大大提高配体与受体的亲和力，其可能原因是N原子替换后，虽然这些生物电子等排体的键角和空间结构非常相近，但是电负性和疏水性不同，因此替换后会发生生物活性改变，与受体的亲和力也随之变化[25]。