《表2 8种单糖与假单糖分子对接结合自由能》

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《小分子糖及其类似物与α-葡萄糖苷酶的分子对接》

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在20个小分子中，1-脱氧野尻霉素的对接结合自由能为-8.26 kcal/mol，井冈霉胺为-8.79 kcal/mol，大大低于其他化合物，说明两种化合物与酶的结合较为牢固，这与两者同属于强效α-葡萄糖苷酶抑制剂的性质一致。虽然其中的单糖分子结构与1-脱氧野尻霉素、井冈霉胺等结构相似，但这些单糖与后两者的对接结合自由能却相差很大，提示1-脱氧野尻霉素和井冈霉胺环上的N原子和C原子可能是影响对接结合自由能的重要因素。将其中的8种单糖（葡萄糖、半乳糖、甘露糖、木糖、海藻糖、果糖、2-脱氧-D-葡萄糖和6-脱氧-D-葡萄糖）糖环上的O原子分别替换为N原子和C原子，构建新的假单糖化合物与酶进行对接，比较每种单糖与原子替换后的N假单糖和C假单糖的结合自由能，结果见表2。