《表1 化合物20、37和54与σ1R之间的结合自由能及其能量分项》
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《立体效应对烷氧基异恶唑类Sigma-1受体抑制剂与Sigma-1受体相互作用的影响》
注:ΔGvdW为范德华贡献;ΔGelec为静电贡献;ΔGpolar为溶剂化贡献;ΔGnonpolar为非溶剂化贡献;ΔGMM为分子力学自由能;ΔGsolv为溶剂化自由能;ΔGbind为结合自由能。
为了考察化合物20、37和54与σ1R之间的结合能力,在分子动力学模拟的基础上,采用MM-GBSA方法计算了这3个化合物与σ1R之间的结合自由能(ΔG),结果展示在表1和图5中。由图5可见,3个化合物与σ1R之间的结合强度按照以下顺序递减:54…σ1R(-46.19 kcal/mol)>20…σ1R(-43.27 kcal/mol)>37…σ1R(-28.02 kcal/mol),这与实验测定的结合常数Ki大小顺序一致(图2),表明计算结果的可靠性。
图表编号 | XD0036903800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.04.08 |
作者 | 罗宏华、谢晓曦、张卓琳、蒋南 |
绘制单位 | 南京医科大学药学院、南京医科大学药学院、南京医科大学药学院、南京医科大学药学院 |
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