《表3 B构象中有显著的结合自由能 (绝对值大于4.182kJ·mol-1) 的残基及其分解的结合自由能数值》

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《Cel48F产物排出过程中酶-底物相互作用及关键残基的分子动力学模拟》

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（2） 疏水相互作用.除了氢键作用外，疏水相互作用在蛋白与底物结合过程中也起到重要作用.从表2中的结合自由能可以看出，在构象A中，在-3～-1一侧，Glu 55、Trp 154、Phe 180和Trp 298拥有最明显的范德华贡献（∣ΔEvdw∣>8kJ·mol-1），并且这些范德华贡献在B和C构象中变化也不大（见表3，表4）.