《表1 Fa HD-Zip I候选基因及其水稻同源序列概况》
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《基于转录组数据库的高羊茅HD-Zip Ⅰ转录因子的鉴定及表达模式解析》
采用14个水稻HD-Zip I蛋白序列(表1)作为搜索请求,在高羊茅本地转录组数据库进行搜索,经分析、组装和拼接,巢式PCR扩增(引物序列见表2),单克隆测序鉴定,得到13个高羊茅HD-Zip I全长ORF序列(表1)。基于水稻的名称(Os HOX)来命名高羊茅HD-Zip I序列(Fa HOXs),并且将其登录到NCBI(Gen Bank登录号:MG189709~MG189721)。结果表明,13个Fa HOX候选蛋白序列长度从221(Fa HOX24)到345(Fa HOX16)个氨基酸,等电点为4.66(Fa HOX16)到6.32(Fa HOX14),分子质量从24604.12(Fa HOX24)到37611.29(Fa HOX16)。亚细胞定位预测结果表明,这13个Fa HOX基因均定位在细胞核中,与其转录因子功能相吻合。
图表编号 | XD0013482900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.03.20 |
作者 | 庄黎丽、王剑、杨志民 |
绘制单位 | 南京农业大学草业学院、南京农业大学草业学院、南京农业大学草业学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |