《表4 定量PCR引物Table 4 Primers used for q RT-PCR》

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《基于转录组数据库的高羊茅HD-Zip Ⅰ转录因子的鉴定及表达模式解析》


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干旱胁迫是目前影响植物生长最大的逆境条件之一,研究植物中耐旱因子有着重要的意义。采用q RT-PCR技术对20%PEG6000模拟干旱处理下高羊茅根颈中HD-Zip I基因的表达进行分析。首先设计定量PCR引物(表4),产物长度108~197 bp。PCR扩增目的条带,进行琼脂糖凝胶电泳检测,Fa HOX20及Fa HOX21均未扩出预期条带。对其余11个基因进行q RT-PCR检测,结果表明,Fa HOX4和Fa HOX6的m RNA表达水平在短期24 h内均不受干旱胁迫影响。Fa HOX5,Fa HOX8,Fa HOX14在处理24 h略微上调表达,而Fa HOX25在干旱处理24 h时下调表达。Fa HOX12,Fa HOX13,Fa HOX16,Fa HOX22,Fa HOX24对干旱胁迫的响应比较快,处理3 h其表达水平均发生显著的上调或者下调。其中,Fa HOX22的表达水平受到干旱胁迫的影响最大,干旱处理6 h时,其表达水平上升了约14倍(图3)。此外,从图3可以看到,几乎所有Fa HOX基因在24 h内其本身的表达也发生变化,这说明其表达量可能受到昼夜节律的影响。