《表1 水稻Rf基因及其同源基因的基本信息分析》
本文开展生物信息学分析的32个基因中,已鉴定功能的Rf基因有6个,均可在国家水稻数据中心查询;已有文献报道但未鉴定功能的有5个,即4个Rf3 candidate gene和Rf19(t);其余没有文献来源的候选基因是在水稻基因组数据库中利用同源检索得到的。其中Rf1a、Rf4等28个基因属于PPR类型基因;Rf2及其同源基因LOC_Os06g22660和LOC_Os02g05890不是PPR类型基因;同样Rf17也不属于PPR类型基因,但其在phytozome数据库中没有检索到同源基因。亚细胞定位预测结果发现,Rf1a、Rf1b、Rf4、Rf6和Rf17等功能基因均定位于线粒体中,功能预测结果也是蛋白结合功能(GO:0005515),与发表文献的研究结果一致,说明利用i Loc-Plant和Inter Pro对其他同源基因的预测结果具有参考价值。
图表编号 | XD00229046300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.01 |
作者 | 王俊杰、梁青、陈伟雄 |
绘制单位 | 广州市农业科学研究院、广州市农业科学研究院、广州市农业科学研究院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |