《表4 癌症紊乱PPI基因对的关键节点基因》

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《PPI基因对在癌症中的共表达分析》


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在存在于2种及以上癌症的癌症紊乱PPI基因对中,一共发现了520个基因,其中某些基因存在于多个PPI基因对中,这类基因属于癌症中的关键节点基因,可能在癌症过程中发挥着非常重要的作用.表4列举了能够与4个以上蛋白相互作用的关键节点基因,其中一些关键节点基因与多个基因能够通过蛋白质相互作用连接成网络模块,比如LRSAM1、ATXN1、SMARCC2、SMARCA2.LRSAM1是一种泛素连接酶,可以特异识别并结合底物,调控细胞凋亡和癌细胞的消除等[28];ATXN1参与Notch信号通路,该通路在决定细胞的增殖分化和凋亡中起重要作用[29],且敲除ATXN1基因可以激活金属蛋白酶(MMPs),进而诱导细胞迁移和侵袭[30];SMARCC2和SMARCA2基因是染色质重塑复合体SWI/SNF的一部分,主要影响基因的转录活性[31],染色质重塑复合体SWI/SNF亚基基因在癌症中的突变率高达20%,致使编码的蛋白失活,甚至整个复合体功能异常,进而诱发癌症.这些相互作用的基因对在肿瘤中的紊乱,可能在一定程度上影响癌症的发生和发展.LRSAM1等基因的相关网络模块如图3(a)所示.