《表4 耗时对比：非序列比对软件SeqDistK在微生物菌群分类中的应用》

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《非序列比对软件SeqDistK在微生物菌群分类中的应用》

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表4所示为使用SeqDistK时不同非序列比对方法（Eu、d2、d2S以及d2star）所需要的计算时间．计算过程在个人电脑上完成，电脑配置为:i7-4790 K [email protected] GHz，32 G内存，Windows10系统．从表4可以看出，SeqDistK可以在个人电脑上以一定时间完成大量序列的比较，2 000条以内的序列量可以快速完成计算，而4种非序列比对方法所需的时间相差不大，计算时间主要由序列数量决定．用Muscle序列比对软件MEGA在相同条件下做一次运行，将其耗时与SeqDistK的耗时对比（见表4最后一行），可发现SeqDistK的耗时远小于Muscle的耗时．