《表5 各癌症差异表达基因及PPI基因对的数目》

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《PPI基因对在癌症中的共表达分析》


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对各癌症的正常样本及癌症样本各时期进行差异表达分析,通过贝叶斯调整的T检验及FDR多重校正,得到各癌症表达谱的显著差异基因.癌症紊乱PPI基因对中,在所有癌症中都具有显著差异的共有94对,而都具有显著差异的癌症特异PPI基因对共19对,具体统计结果如表5所示.对癌症紊乱及癌症特异的具有显著差异的PPI基因对在所对应的癌症中进行生存分析,利用SPSS对PPI基因对进行cox回归分析后,再通过R的survival包进行生存分析,结果显示,有16对显著差异PPI基因对在7个癌症中具有显著生存差异(P<0.01),具体PPI基因对及对应的癌症见图4.其中,LUAD的GRK5-ARRB1基因对中,GRK5可激活ARRB1,促进葡萄糖摄取和糖酵解,通过调节TCA循环代谢物,诱导假缺氧条件下HIF1A的激活,后者可使细胞代谢从氧化磷酸化转至有氧糖酵,促进癌细胞的生长增殖[37];BRCA的TPM3-TMOD1基因对中,TPM3作为一种重要的致癌基因,受TMOD1的调控,能够激活EMT信号通路,在人类恶性肿瘤的侵袭和迁移中起着重要作用[38];KIRC的TRPV5-CALB1基因对中,TRPV5作为钙离子高选择性通道,受到CALB1的调控,激活后可增加细胞内的Ca2+水平,促进癌细胞的增殖、迁移及抑制其凋亡[39].这些关键的具有表达差异及显著生存差异的PPI基因对在癌种中的具体作用机制有待进一步的实验验证.