《表3 差异表达基因数目统计》

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《‘枸头’橙针刺和枝的转录组分析》

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采用DES q （Anders and Huber，2010）以padj（FDR）<0.05 （表达上调或下调）为标准对差异基因进行筛选，FDR值越小，表达差异越显著。筛选结果显示共获得5 441个差异表达基因，其中包含2 881个上调表达的差异基因，2 560个下调表达的差异基因（图1）。各上调或下调表达差异表达基因的|log2FC|高度不一，差异水平变化主要集中在0～1 （上调基因占43.01%，下调基因占56.99%）和1～3 （上调基因占57.93%，下调基因占42.07%）；其次是3～6，上调基因占77.89%、下调基因占22.11%；再次是6～11，上调基因占84.85%、下调基因占15.15%，达到10以上的差异表达基因只有3个，全为上调表达（表3）；其它只在GTCS或GTCP中表达的差异基因有38个。