《表3 差异表达基因KEGG通路统计》

《表3 差异表达基因KEGG通路统计》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于RNA-Seq技术的茶树响应高温胁迫转录组差异性分析》


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对高温胁迫前后‘福鼎大白茶’和‘早白尖5号’两个对比组进行KEGG数据库注释,分析茶树遭遇高温胁迫时,差异基因主要参与的代谢途径。分析发现,fuHT vs fuCK对比组共有941个差异基因注释到76个代谢通路中,zaoHT vs zaoCK对比组有276个差异基因成功注释到40个代谢通路中。将两个对比组差异基因显著性富集排名前20的Pathway进行统计(表3),可以看出,两个对此组显著富集的Pathway前3名均为代谢途径(Metabolic pathways)、内质网中的蛋白质处理(Protein processing in endoplasmic reticulum)、次级代谢物的生物合成(Biosynthesis of secondary metabolites),三者富集的差异基因数目在‘福鼎大白茶’和‘早白尖5号’对比组差异基因总数中所占的比例分别为15.52%、8.7%,12.43%、8.3%,7.2%、5.1%。植物-病原互作(Plant-pathogen interaction)在‘早白尖5号’对比组中富集差异基因9个,排名第5,在‘福鼎大白茶’对比组中富集差异基因36个,排名第6;内吞作用(Endocytosis)在‘早白尖5号’比较组中富集差异基因12个,排名第4,在‘福鼎大白茶’比较组中富集差异基因24个,排名第10;碳代谢(Carbon metabolism)在‘福鼎大白茶’和‘早白尖5号’两个比较组中富集的差异基因分别为27个、6个,排名均为第7名;其余Pathway无法在两个比较组中同时富集较多的差异基因。以上代谢途径可能是茶树响应高温胁迫的关键调控途径。