《表1 测序数据输出质量情况》
分别取枸头橙针刺和嫩枝顶端组织进行了高通量转录组测序,数据初步分析结果表明得到的原始测序序列(Raw reads)中含有带接头(Adapter)的、低质量(Low quality)的Reads,两组样品的Raw reads都在4 653万条以上。在去除0.88%~1.70%带接头的reads、0.15%含N的Reads (N表示无法确定碱基信息)和0.11%~0.22%的低质量Reads (Qphred≤20的碱基数目占整条Read长度50%以上的Reads)后得到Clean reads。经过滤分析后,两组样品分别共得到24.97 G(GTCS)和25.61 G (GTCP)的有效Reads (Clean Reads),后续所有分析都基于Clean reads。各样品得到的Clean reads的量占原始Reads的比例都达到了97%以上,且各样品Q30碱基百分比均不小于92.55%,GC含量为44.10%~44.52%。上述这些测序质量评估结果表明测序所获得的数据可靠,并具有良好的建库质量,所有数据可为后续分析所用(表1)。
图表编号 | XD00220556900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.14 |
作者 | 孙立方、柯甫志、聂振朋、王平、孙建华、黄秀、徐建国 |
绘制单位 | 浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心、浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心、浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心、浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心、浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心、浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心、浙江省柑橘研究所国家柑橘品种改良中心浙江分中心 |
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