《表1 测序数据质量及分类概述》

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《赣州橘园根系内生丛枝菌根真菌群落多样性鉴定及其受黄龙病菌侵染的影响》

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笔者采用了454高通量测序的方法对柑橘根系内生AMF群落及其受黄龙病菌侵染的影响进行了系统性的分析。采集了江西省赣州市寻乌县同一个果园中黄龙病菌侵染以及非侵染的柑橘根系材料，并提取DNA使用AMF的18S小亚基核糖体特异引物AMV4.5NF/AMDGR进行建库测序。通过454高通量测序，总共得到89 456条原始序列，经过序列的处理与筛选，其中52 909条序列符合有效序列的标准。使用QIIME软件按照97%的相似度进行聚类后，总共产生238个OTU。为了对OTU的分类进行鉴定，将序列与MAARJAM数据库中丛枝菌根的序列进行比对，发现50 494条序列被分类到球囊霉门（即AMF），占总有效序列数的95.44%，说明了特异引物AMV4.5NF/AMDGR对柑橘根系内生AMF的扩增效率和特异性都很高，保证了数据的可靠性（表1）。根据分类得到的OTU数绘制了稀释曲线（图2），发现所有样品的稀释曲线都是接近于抛物线型的，说明测序深度已经能够反映柑橘根系内生AMF群落的整体情况，进一步保证了数据的可靠性。