《表2 测序数据及质量参数》

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《京海黄鸡柔嫩艾美耳球虫感染后盲肠转录组分析》

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转录本测序结果及质量参数见表2。由表可见，每个样本100个碱基（bp）长度的raw reads的数量在52 432 520到64 910 184之间，说明丰度高；GC碱基的百分含量在49.18%-50.62%之间，说明各样本的GC含量较为一致；质量值Q20在96%以上，表明RNA-seq测序数据的数量和质量均较高，可以用于后续分析。为了排除接头和低质量reads对转录信息分析的干扰，6个样本去除带接头、低质量和N(N表示无法确定碱基信息）比例大于10%的reads后得到34.8 Gb的clean reads。共有80%的clean reads比对到鸡参考基因组上，其中78%是有唯一比对位置的reads。