《表2 质控前后样本测序数据的质量》

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《用高通量测序技术研究松辽黑猪与长白猪背最长肌mRNA和lncRNA的差异表达》

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SL表示松辽黑猪，L表示长白猪。

本研究通过Illumina HiSeqTM 2000测序平台对松辽黑猪和长白猪的背最长肌组织m RNA进行测序，每个样本平均得到约10G数据量。测序数据的Q20在96%以上，Q30在91%以上，测序质量良好。对原始数据质控后，平均每个样本得到18 224 475 795条150bp的clean reads（表2）。除去比对到核糖体RNA上的reads后，平均81.22%的clean reads比对到猪的参考基因组中，其中唯一比对到基因组位置的为79.49%。各项数据显示测序数据的质量较好，可以进行后续的分析。