《表1 各样品测序数据质控统计表》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《TOR介导的糖激活SAM活性的拟南芥自然变异位点鉴定》
Clean Reads:原始数据过滤后剩余的高质量的Reads数;Clean Base:高质量测序数据总碱基数;GC:Clean Data中的GC碱基占所有碱基的比例;Q30:Clean Data中质量值大于或等于30的碱基所占百分比。
从1级和4级的F2株系中分别选取20株单株构建混合池,对2个混合池和亲本之一CS76205进行全基因组测序。将原始数据中的低质量数据过滤掉以后共获得33.65 G的高质量数据,平均每个样品11.22 G高质量数据,碱基质量Q30比例达到92.23%,GC含量为38.31%(表1)。这些说明所有样本的数据量足够,测序质量合格,GC分布正常,测序数据与亲本基因组比对结果正常,可用于后续的变异检测及性状的基因定位。
图表编号 | XD0086767100 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.06.20 |
作者 | 秦萍、李平、孙爱清、杨静、滕胜 |
绘制单位 | 上海大学生命科学学院、中国科学院上海植物生理生态研究所分子植物科学卓越创新中心光合与环境实验室、上海大学生命科学学院、中国科学院上海植物生理生态研究所分子植物科学卓越创新中心光合与环境实验室、中国科学院上海植物生理生态研究所分子植物科学卓越创新中心光合与环境实验室、中国科学院上海植物生理生态研究所分子植物科学卓越创新中心光合与环境实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |