《表1 各样品测序基本数据信息》
在PCR扩增过程中会产生嵌合体和靶区域外序列,其中嵌合体是由于不同的模板混杂产生的错误序列,并非真实存在,而靶区域外序列则是引物非特异性靶定产生的序列,都会影响后续的序列分析质量。为了得到更高质量及更精准的分析结果,需要进行质量控制,即对有效序列进行去杂。如表1所示,采用高通量测序技术对三文鱼片在冷藏过程中的菌相进行分析,样品测序的总序列数为128531,其中,第0、1、2、3、4天五个样品的测序的序列数分别为22742、25858、29643、25968及24320。质量控制后样品的总序列数为116180,各样品的序列数分别为21594、25356、25873、22796、20561,平均长度分别为421.7、423.6、424.5、424.2、424.1bp。质量控制后所有序列长度均为420~480 bp,满足前期设计引物时对目的片段约为465 bp的要求[21-22]。
图表编号 | XD00107294800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 房杰、孟永宏、张英、尤毅娜、郭玉蓉 |
绘制单位 | 陕西师范大学食品工程与营养科学学院、陕西师范大学食品工程与营养科学学院、陕西师范大学食品工程与营养科学学院、陕西师范大学食品工程与营养科学学院、陕西师范大学食品工程与营养科学学院 |
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