《表2 各样品SLAF-seq测序数据统计表》

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《基于SLAF-seq技术分析甜、糯玉米种质遗传多样性》

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通过电子酶切预测，最终选用RsaI进行酶切，将酶切片段长度为364～394 bp的序列定义为SLAF标签，预测能得到155 447个SLAF标签，在玉米基因组10个染色体上分布基本均匀，平均SLAF间距在14 497～15 017 bp。序列分析表明，实验中RsaI的酶切效率为94.26%，共得到209.00 MReads。通过SOAP[15]软件将Control的测序reads与其参考基因组进行比对，结果显示，双端比对效率在97.52%，比对效率基本正常，SLAF建库正常，说明SLAF标签酶切方案可行。对各样品的测序数据进行统计，共获得209.38 MReads数据，测序平均Q30（测序质量值大于或等于30的碱基所占百分比）为91.04%，表明测序质量很高，平均GC含量为44.05%（表2）。