《表1 样品测序数据及比对结果统计》

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《大白菜叶柄黑点症抗性相关候选基因的挖掘》


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对20个高抗叶柄黑点症F2单株和20个高感F2单株构建的混合池以及两亲本开展全基因组重测序,测序过滤后得到的4个样本的有效序列数据量在36 167 382~45 207 635之间,Q30在91.50%~93.35%之间,平均测序深度在21~27 X之间,基因组覆盖度在94.03%~95.87%之间,GC含量在38.23%~38.76%。4个样本与参考基因组平均比对效率在97.57%~98.17%之间(表1)。由此可知,所有样本的数据量足够,测序质量合格,GC分布正常,测序数据与大白菜参考基因组比对结果正常,可用于后续的变异检测及性状的关联分析。