《表2.样品测序数据与unigenes的比对结果》
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《NaCl胁迫下哈茨木霉ACCC32524的转录组和代谢组分析》
使用Illumina Hiseq XTen对9个转录样本进行测序,各样品Clean Data均达到6.29 Gb,Q30(1000个碱基有1个会识别出错)碱基百分比在89.87%及以上。经de novo拼接组装后,得到44594条unigenes,平均长度为1020.47 bp,N50为2205 bp。将各样品的Clean Data与Unigene库进行序列比对,比对结果统计见表2,匹配率均在68%以上。计算各样品间皮尔逊相关系数r(Pearson’s correlation coefficient)作为样品间相关性的评估指标,r2越接近1,说明2个样品的相关性越强[14]。根据各样品间r2做相关性热图(图2),结果表明0.6 mol/L NaCl处理下样品基因表达情况与对照出现差异显著,而0.4 mol/L处理后的样品与对照和0.6 mol/L NaCl处理后的样品r2均在0.75–0.85,说明0.4 mol/L NaCl对于ACCC32524的生长胁迫程度较弱,聚类结果显示各样品的生物学重复之间聚类情况较好。
图表编号 | XD00210335100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.11.04 |
作者 | 向杰、陈敬师、夏鑫鑫、刘快、李世贵、顾金刚 |
绘制单位 | 中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室、中国农业科学院农业资源与农业区划研究所农业农村部农业微生物资源收集保藏重点实验室 |
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