《表2.样品测序数据与unigenes的比对结果》

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《NaCl胁迫下哈茨木霉ACCC32524的转录组和代谢组分析》


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使用Illumina Hiseq XTen对9个转录样本进行测序,各样品Clean Data均达到6.29 Gb,Q30(1000个碱基有1个会识别出错)碱基百分比在89.87%及以上。经de novo拼接组装后,得到44594条unigenes,平均长度为1020.47 bp,N50为2205 bp。将各样品的Clean Data与Unigene库进行序列比对,比对结果统计见表2,匹配率均在68%以上。计算各样品间皮尔逊相关系数r(Pearson’s correlation coefficient)作为样品间相关性的评估指标,r2越接近1,说明2个样品的相关性越强[14]。根据各样品间r2做相关性热图(图2),结果表明0.6 mol/L NaCl处理下样品基因表达情况与对照出现差异显著,而0.4 mol/L处理后的样品与对照和0.6 mol/L NaCl处理后的样品r2均在0.75–0.85,说明0.4 mol/L NaCl对于ACCC32524的生长胁迫程度较弱,聚类结果显示各样品的生物学重复之间聚类情况较好。