《表2 各样品中高通量测序数据统计》

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《一种中草药复方和11种单方的体外抑菌效果及对大菱鲆肠道菌群的影响》

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对4个样品的高通量测序数据进行统计（表2），结果显示，各样品获得的高质量序列数量均超过40 000条，保持在一个相当的水平，而肠道内容物样品中的可操作分类单元数量略高于肠道组织，说明肠道内容物中的细菌多样性高于肠道组织中的细菌多样性。反应样品多样性的Chao1、ACE、辛普森、香农指数值统计结果同样表明，肠道内容物中微生物群落的多样指数值略高于肠壁上的群落多样性，且在投喂中草药后群落的多样性有进一步的提升。利用QIIME软件对可操作分类单元丰度矩阵中每个样本的序列总数在不同深度下随机抽样，以每个深度下抽取到的序列数及其对应的可操作分类单元数绘制稀疏曲线（图1），随着随机抽取的序列数进一步增加，各样品曲线逐渐趋于平缓，表明有效测序数量已经能够较好地覆盖菌种的多样性，本次取样深度可信，测序结果能够真实地反映样品中优势细菌的数量关系。