《表2 各样品高通量测序结果分析》

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《患肠炎病海马的肠道细菌结构特征分析》

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对6个样品的测序数据经过OTU比对后，绘制了不同样品的稀释曲线，从图2可以看出，6个样品的稀释曲线均随序列数量的增加而趋于平缓，表明所测的数据量已经可以反映微生物群落结构和多样性（图2A）。进一步将6个样品按照健康与患病海马分为2组，每组的3个生物学重复样品，合并进行分析。以97%的相似性对序列进行聚类，相似度大于97%的序列将聚为同一个OTU，健康和患病样品中有效OTUs数目分别为547、434个，但是健康海马肠道微生物的ACE、Chao1指数低于患病海马，表明健康海马的肠道微生物物种数目低于患病海马组。健康海马肠道微生物的Shannon多样性指数高于患病海马组，并且Simpson多样性指数低于患病海马组，表明在微生物多样性方面，健康海马的肠道中微生物的菌群多样性高于患病海马（表2）。最后，分别对2种样品绘制等级分布曲线，结果如图2B所示，在水平方向上，患病海马组的曲线在横轴上的跨度大于健康海马组，也表明患病海马组的微生物物种数目高于健康海马，同时在垂直方向上患病海马的曲线比健康海马陡峭，表明患病海马样品中存在相对丰度明显占优的细菌种类。