《表1 样品高通量测序结果Tab.1 High-throughput sequencing results for samples》

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《双斑东方鲀循环水养殖水体细菌群落结构分析》


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患病的(1#)和健康的(2#)2个养殖水体样品获得的有效序列条数分别为66 507、53 823,序列的平均长度在450 bp左右,符合测序要求(表1)。从样品稀释曲线看,稀释曲线总体趋势为:在<10 000条序列时,OTU数量随着样品的序列数增加而迅速增加;在10 000~30 000条序列时,OTU数目增加缓慢;之后则趋于平台期(图3);说明2个样品测序饱和,可覆盖样品中大部分OTU,数据可靠。患病的(1#)和健康的(2#)养殖水体样品中OTU数目分别为435和422个,共有OTU数为402个,各自特有OTU数分别为33和20个;Venn图的结果表明,患病的(1#)和健康的(2#)养殖水体菌落组成有90%以上重叠,二者菌落种类组成相似度高 (表1,图3)