《表1 Illumina Hi Seq PE250测序结果Tab.1 Sequencing results of Illumina Hi Seq PE250》

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《湿热地区O_3/BAC工艺的微生物多样性解析》


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对Illumina Hi Seq测序平台得到的下机数据进行拆分、拼接、过滤、质控等处理后得到最终的有效数据(Effective Tags)[10~14]。7样本共获得385 499条有效数据,共97 986 718个Base,序列平均长度Avglent为254.18。使用Qiime软件(Version1.7.0)计算Observed_species、Chao1、Shannon、Simpson、ACE、Goods_coverage、PD_whole_tree指数,测序结果如表1所示,使用R软件(Version 2.15.3)绘制稀释曲线,如图1所示(横坐标为从某个样品中随机抽取的测序条数,纵坐标为基于该测序条数能构建的OTUs数量,用来反映测序深度情况)。