《表1 Illumina Hi Seq PE250测序结果Tab.1 Sequencing results of Illumina Hi Seq PE250》
对Illumina Hi Seq测序平台得到的下机数据进行拆分、拼接、过滤、质控等处理后得到最终的有效数据(Effective Tags)[10~14]。7样本共获得385 499条有效数据,共97 986 718个Base,序列平均长度Avglent为254.18。使用Qiime软件(Version1.7.0)计算Observed_species、Chao1、Shannon、Simpson、ACE、Goods_coverage、PD_whole_tree指数,测序结果如表1所示,使用R软件(Version 2.15.3)绘制稀释曲线,如图1所示(横坐标为从某个样品中随机抽取的测序条数,纵坐标为基于该测序条数能构建的OTUs数量,用来反映测序深度情况)。
图表编号 | XD0021509000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.01 |
作者 | 周常、蔡广强、张金松、黄河洵 |
绘制单位 | 广州大学土木工程学院、深圳市水务<集团>有限公司、哈尔滨工业大学<深圳>土木与环境工程学院、深圳市水资源利用与环境污染控制重点实验室、广州大学土木工程学院、深圳市水务<集团>有限公司、哈尔滨工业大学<深圳>土木与环境工程学院、深圳市水资源利用与环境污染控制重点实验室、深圳市水务<集团>有限公司 |
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