《表3 RZ1、RZ2、RZ3三种样品16S rDNA高通量测序基本信息》

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《不同季节使用微生态制剂后养殖海水细菌群落特征》


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冬季养殖海水RZ1通过16S rDNA高通量测序技术过滤掉低质量碱基后共得到原始序列78 148条,然后进行嵌合体过滤,最终用于后续分析的有效序列67 069条。按照上述筛选方法,春季RZ2过滤掉低质量碱基后的原始序列为84 025条,用于后续分析的有效序列为67 743条,夏季RZ3分别为76 206条和62 732条。为了研究各样本的物种组成,对所有样本的有效序列以97%的一致性进行OTUs聚类,RZ1、RZ2、RZ3分别有134、162、194个OTUs。通过OTUs聚类的结果表明,RZ1混合菌分属于13个门,18个纲,38个目,65个科,89个属;RZ2混合菌分属于15个门,19个纲,43个目,60个科,77个属;RZ3混合菌分属于16个门,22个纲,47个目,48个科,58个属,以上分析结果如表3所示。