《表2 RZ1、RZ2、RZ3三种样品多样性指数统计》
Alpha Diversity用于分析样本内(Within-community)的微生物群落多样性,通过对样本的多样性分析可以反映样本内微生物群落的丰富度和多样性。Alpha Diversity分析指数包括shannon、simpson、chao1、ACE、goods_coverage、PD_whole_tree。冬季RZ1、春季RZ2、夏季RZ3三种复合菌的Alpha多样性分析见表2。观测物种数、Chao1指数和ACE指数值越大,表示样品中群落丰富度越高,Shannon指数反映群落的多样性,Simpson指数反映群落中优势种的集中程度,Shannon指数越大,Simpson指数越小,说明样品中的物种多样性越高[9]。上述结果显示微生物丰富度和多样性整体情况夏季>春季>冬季,夏季物种丰富,而冬季和春季物种相对单一。PD_whole_tree指数反应了样品中物种对进化历史保存的差异,PD_whole_tree指数越大说明物种对进化历史保存的差异越大[10]。goods_coverage指数反应了测序的深度,goods_coverage指数越接近于1,说明测序深度已经基本覆盖到样本中所有的物种。
图表编号 | XD00123671500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.26 |
作者 | 王永妍、赵炳赫、梁广钰、李云、徐仰仓 |
绘制单位 | 天津科技大学海洋与环境学院、天津科技大学海洋与环境学院、天津科技大学海洋与环境学院、上饶师范学院、天津科技大学海洋与环境学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |