《表1 样品Alpha多样性指数统计表》
Alpha多样性用于分析单个样品内的微生物群落多样性和丰富度,它有多种衡量指标:Sobs指数表示样本中观察到的物种数目,Chao1和ACE指数衡量物种丰度,Shannon和Simpson指数用于衡量物种多样性,受群落中各物物种丰度和均匀度的影响[16]。OTU覆盖率数值越高,则样品中物种被测出的概率越高。如表1所示,所有样品的OTU覆盖率均在98%以上,说明测序结果可以反应样本中微生物真实情况。样品NF_5的ACE和Chao1指数最高,说明其物种数量最多,而且其Shannon指数最高,Simpson指数较小,说明其物种丰度和均匀度最高,即多样性最高;样品MF_5的ACE和Chao1指数最低,说明其物种数量最少;样品NF_1的Shannon指数最低,Simpson指数最高,其物种多样性最低。
图表编号 | XD00132287700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.20 |
作者 | 王鸣秋、杨硕、刘艳、辛瑞鹏、李诗瑶、张莉 |
绘制单位 | 湖北省食品质量安全监督检验研究院、武汉市卫生健康委员会、湖北省食品质量安全监督检验研究院、武汉市公安局刑侦局、湖北省食品质量安全监督检验研究院、湖北省食品质量安全监督检验研究院 |
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