《表1 样品Alpha多样性指数统计表》

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Alpha多样性用于分析单个样品内的微生物群落多样性和丰富度,它有多种衡量指标:Sobs指数表示样本中观察到的物种数目,Chao1和ACE指数衡量物种丰度,Shannon和Simpson指数用于衡量物种多样性,受群落中各物物种丰度和均匀度的影响[16]。OTU覆盖率数值越高,则样品中物种被测出的概率越高。如表1所示,所有样品的OTU覆盖率均在98%以上,说明测序结果可以反应样本中微生物真实情况。样品NF_5的ACE和Chao1指数最高,说明其物种数量最多,而且其Shannon指数最高,Simpson指数较小,说明其物种丰度和均匀度最高,即多样性最高;样品MF_5的ACE和Chao1指数最低,说明其物种数量最少;样品NF_1的Shannon指数最低,Simpson指数最高,其物种多样性最低。