《表2 样品信息、序列丰度和多样性指数统计》
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《内蒙古科尔沁地区食疗用酸马奶发酵引子化学成分及细菌多样性分析》
通过Illumina MiSeq第2代测序技术,纳入本研究的3个样品共产生230 091条原始序列,经过质控和过滤后共得到186 248条高质量优化序列,各样本所产生序列数见表2,该酸马奶引子样品平均获得62 082.7条优化序列。将所得优化序列以97%的相似性进行聚类,相似度大于97%的序列将聚为同一个OTU,同时使用de novo模式去除嵌合体序列,最终产生34.3个OTU,每个样品OTU聚类后使用mothur软件找出与OTU序列相似度最高且可信度达80%以上的物种信息用于OTU注释。该酸马奶引子样品可以注释到1个界、4个门、8个纲、13个目、22个科、25个属和28个种,各分类水平上的OTU数目见表3。
图表编号 | XD0075175200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.25 |
作者 | 乌日汗、包连胜、包秀萍、李爽、王歆远、贾士儒 |
绘制单位 | 天津科技大学生物工程学院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学附属医院康复保健医院、内蒙古民族大学附属医院康复保健医院、内蒙古民族大学生命科学学院、内蒙古民族大学生命科学学院、天津科技大学生物工程学院 |
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