《表1 样品的信息、序列丰度以及微生物多样性》

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《山西地方自然发酵蔬菜发酵过程中细菌多样性分析》


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基于在97%相似度水平的OTU数,各样品Alpha多样性指数值统计如表1所示,发现V4中具有较丰富的多样性。Chao1指数和ACE指数衡量物种丰度,ACE指数与OTU数结果相似。8个样品中的Simpson指数和Shannon指数在0.22~2.23之间,V1~V7的Simpson指数和Shannon指数呈反比,且V1、V7数值相差较多,V7的多样性指数最高。另外还统计了OTU覆盖率,其数值在0.999 3~0.999 7之间,结果表明,取样合理覆盖程度较高,能够反映出样品的真实情况。