《表3 AEW处理鲈鱼片序列信息和Alpha多样性指数》
注:将相似度97%的序列聚类为OTUs;ACE指数、Chao1指数反映菌种丰富度,数值越大,说明群落物种丰富度越高。
通过基于Illumina MiSeq平台的高通量测序分析贮藏初始阶段(第0天)和腐败时(第3天)鲈鱼片的微生物群落组成。由表3可知,样品经质控、过滤处理后,通过细菌16S rRNA基因Illumina测序获得总共1 500 212个高质量读数,每个样品的有效序列数均在10 000以上,有效序列百分比达50%以上,表明测序所得到的有效序列可达到后续微生物多样性分析的要求。在97%相似水平下,进行OTU生物信息统计,随着贮藏时间的延长,CK、AEW1、AEW2组鲈鱼片OTU数量明显增加,AEW3组贮藏末期较少,表明AEW3组鲈鱼片菌群种类较少。贮藏0 d时,AEW3组鲈鱼片ACE指数、Chao1指数最高,香农指数最大且辛普森指数最小,说明贮藏初期AEW3组鲈鱼片的物种丰富度和微生物多样性最大。CK、AEW1、AEW2组鲈鱼片贮藏第3天的ACE指数、Chao1指数和辛普森指数明显高于第0天,而AEW3组贮藏第3天的ACE指数、Chao1指数和香农指数明显低于第0天,表明AEW3组鲈鱼片贮藏末期微生物群落丰富度和多样性降低。
图表编号 | XD00136513700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.29 |
作者 | 向雅芳、熊光权、乔宇、汪兰、吴文锦、丁安子、李新、石柳、卢素芳、黎彩 |
绘制单位 | 湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、湖北省农业科学院农产品加工与核农技术研究所、武汉市农业科学院水产研究所、武汉梁子湖水产品加工有限公司 |
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