《表3 样品的序列及Alpha多样性指数》

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《双孢蘑菇培养料发酵过程中细菌群落动态变化》

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通过对双孢蘑菇培养料堆肥样品中细菌16S rRNA基因的V3/V4区进行测序，共获得309 462条高质量序列，每个样品序列标准化后为51 577条（表3）。根据Barcode标签进行样品序列拆分，在对初始序列进行去冗余处理后，获得16S rRNA基因Unique Reads，并在97%相似度下将其聚类为用于物种分类的OTUs，统计得到各个样品在不同OTUs中的丰度信息，6个样品共产生854个OTUs（表3）。其中双孢蘑菇培养料建堆期、一次发酵和二次发酵过程分别获得了396、812和403个细菌OTUs，其中只有185个OTUs存在于堆肥整个过程中（图2）。