《表1 14份奶酪样品的序列信息及α多样性指数》

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《新疆伊犁牧区传统手工奶酪中微生物多样性及其功能分析》


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注:同列不同小写字母表示不同奶酪样品间差异显著,P<0.05。

常用到的α多样性指数包括丰富度指数(Sobs指数、Chao1指数)、多样性指数(Simpson指数、Shannon指数)以及群落覆盖度指数Coverage等[24]。本研究中所得到的奶酪样品序列信息及α多样性指数如表1所示,14份奶酪样品共得到的细菌原始序列为561 955条,质控过滤后得到的有效序列为545 560条。在物种丰度上,阿勒泰地区T2样品的Sobs和Chao1指数最大,说明其细菌数目最多,且与其他样品差异显著;阿勒泰地区B7和额敏地区E2样品的Sobs和Chao1指数较小,其细菌数目较少,B7与E2样品的Sobs指数无显著差异,但其Chao1指数存在显著差异。在物种多样性上,样品T2的Simpson指数最小,Shannon指数最大,说明其细菌多样性最高,且与其他样品有显著差异;样品B7的Simpson指数最大,Shannon指数最小,说明其细菌多样性最低。14份样品的Coverage指数均接近于1,说明样品中的序列基本都被完全测出,测序结果能够充分反映样品中的细菌多样性,但B7样品的Coverage指数与其他样品差异显著。