《表1 样品中细菌丰度及α多样性指数》

《表1 样品中细菌丰度及α多样性指数》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《高通量测序分析胡萝卜连作与轮作土壤细菌多样性》


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使用FLASH软件将各样品原始序列进行拼接,再经过质控及嵌合体过滤得到可用于后续分析的有效序列,4个样品最终获得196 220条有效序列,序列平均长度为255 bp,长度分布在186~379 bp之间。以97%的序列一致性将样品的全部Effective Tags聚类成为9 092个OTUs。本研究测试得到4组样品的α多样性指数结果(表1),序列覆盖率为97.9%~98.7%,当获得一致序列数28 890时,各样品稀释曲线趋于平稳(图1),表明该测序深度已获得绝大多数样本信息,基本能反映土壤环境中细菌的多样性及丰富度。