《表3 堆肥样品中细菌丰度与多样性Table 3 Bacterial richness and diversity in composting samples》

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《基于高通量测序分析牛粪堆肥中细菌群落动态变化》

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所有堆肥样品通过高通量测序共获得274 759条高质量序列，依次为34 881、40 862、38 112、43 382、42 763、39 202和35 557条。为更好比较分析，所有样品序列标准化为18 182条。表3分别是堆肥样品优化序列、OTU数量及多样性指数。对标准化序列基于97%相似度水平划分，共获得1 001个OTUs。由表3可知，堆肥过程中7个样品被检测OTU数量先逐渐增加，C4达最高值为542，之后依次减少，C7 OTU数量最少为179个，说明本次堆肥中高温期细菌群落丰度最高。本研究通过分析各样品文库覆盖率（Coverage）和稀释曲线说明测序深度。表3中各样品文库覆盖率均超过99.3%，说明堆肥样品中基因序列被检概率较高；图2是各样品OTUs稀释曲线，随机抽样序列，以抽到序列数与其所代表OTU数目构建稀释曲线，曲线趋向平坦时，说明测序数据量合理，更多数据量会产生少量新OTU，反之则表明继续测序还可能产生较多新OTU，由图2可知各样品稀释曲线均趋于平坦，表明本次测序深度满足分析要求。综合各样品文库覆盖率和稀释曲线认为本次测序结果可代表堆肥中细菌群落真实情况。