《表1 南海深海氮源原位富集样品的细菌与古菌Alpha多样性参数Tab.1 Alpha diversity parameters of bacteria and archaea from the in

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《南海深海氮循环微生物的原位培养与多样性分析》

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采用Illumina miseq测序平台对南海深海原位富集物的脱脂棉样品（NH＿MH1、NH＿MH2）和仓内水样（NH＿SY1和NH＿SY2）进行16S rRNA基因高通量测序.共测得531 658条有效序列，其中包括4个样品测得的245 706条细菌有效序列，3个样品（NH＿SY2古菌序列测序失败）测得的285 952条古菌有效序列，片段平均长度在441～449 bp之间.将得到的序列进行拼接，同时对序列质量进行质控和过滤，得到178 668条细菌有效序列和134 001条古菌有效序列，按照97%相似度对序列进行OTU聚类，共得到515个OTUs，包括466个细菌OTUs和49个古菌OTUs.基于OTU聚类分析结果，对样本的Alpha多样性指数（主要包括Chao值、Simpson指数、Shannon值和ACE值等）进行分析，如表1所示，可以看出南海深海氮源原位富集样品中的微生物种类丰富.稀释曲线分析表明，随着测序数量的增加，稀释曲线逐渐趋于平缓（图2），表明该测序量已经能够反映该实验中细菌和古菌群落多样性.