《表3 5个实验室二次富集物的细菌Alpha多样性Tab.3 Alpha diversity of bacteria from five secondary enrichments in labora
采用Illumina miseq测序平台对实验室二次富集的5个样品进行细菌16S rRNA基因高通量测序,共获得352 572条有效序列,片段平均长度449 bp左右.对序列进行拼接、质控和过滤,得到275 495条有效序列,按照97%相似度对序列进行OTU聚类,共得到25个OTUs.基于OTU聚类分析结果,对样本的Alpha多样性指数进行分析,各样本Alpha多样性指数如表3所示,与原位富集样品相比,样品经实验室条件下的二次选择性富集后,后者OTU数目、Shannon指数远远小于前者,说明实验室二次富集后微生物的多样性降低.
图表编号 | XD0042994200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.15 |
作者 | 王蕾、王丽萍、董纯明、李小义、李登峰、邵宗泽 |
绘制单位 | 宁波大学海洋学院、自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室、自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室、自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室、自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室、宁波大学海洋学院、宁波大学海洋学院、自然资源部第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室 |
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