《表2 测序数据的质量情况统计表》

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《不同来源相同背景人肿瘤细胞系的转录组特征比较》

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注:Q20:碱基质量Phred数值>20的碱基数占总碱基数的百分比；Q30:碱基质量Phred数值>30的碱基数占总碱基数的百分比；GC:鸟嘌呤（G）和胞嘧啶 （C）

对各株HeLa和HepG2细胞进行转录组测序，测序数据情况（表2）表明，其中，HeLa-ATCC细胞共获得了33 235 829个原始读数，过滤后获得32 747 196个净读数；HeLa-自存细胞共获得了29268148个原始读数，过滤后获得28 770 988个净读数。HepG2-ATCC细胞共获得了59 936 566个原始读数，过滤后获得58 794 278个净读数；HepG2-自存细胞共获得了59 415 742个raw reads，过滤后获得57 990 000个净读数。4株细胞测序数据的Q20值分别为96.7%、96.97%、96.65%和96.82%，Q30值分别为91.36%、91.91%、91.76%和92.04%，GC含量分别为51.48%、53.81%、57.11%和53.72%。可见，测序数据质控良好，净读数质量合格，可用于生物信息学分析。