《表1 癌症样本情况及组织特异PPI基因对数量统计》

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《PPI基因对在癌症中的共表达分析》


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通过对STRING数据库及HPRD数据库的PPI基因对进行严格筛选(实验分数>400,可信分数>700),得到52801对高度可信的PPI基因对集合,共10 581个基因.此外,由于PPI基因对具有组织特异,筛选在正常组织均有转录表达(TPM≥1)的PPI基因对为各癌症的组织特异PPI基因对集合,作为后续研究的基础.表1所示为各癌症各时期的样本数目及其组织特异PPI基因对集合的统计数目,其中33537对PPI基因对在各癌症中均有表达,约占癌症特异PPI基因对集合的70%,说明癌症在一定程度上具有相似性,同时也说明各癌症间具备了一定的异质性.